從對審計人員的要求看，經過多年的積累和規(guī)范,，項目審計有較固定的模式,，對審計人員的要求主要集中在以財政財務知識為基礎，對各項會計準則和審計準則的正確把握,。而審計調查不僅要求審計人員有查賬的知識,，更側重與調查內容相適應的管理知識、專業(yè)知識,、政策水平,，要了解國家的大政方針等等。寫作水平相對要求高,，調查報告不僅要揭示存在的問題,，更要有問題的成因分析，要有調查結論和改進建議,。
由于存在上述的不同,，導致兩種方式發(fā)揮作用的效果不同。項目審計對問題的處理或評價是具體的,，針對某事或某項具體行為,，對被審計對象具體行為的糾正有較強的作用。對上級管理者而言,，它能較具體地了解某單位某事項的情況,，而審計調查涉及的面廣，層次高,，政策性強,。對被調查的個體而言，不出具具體行為的處罰糾正決定,，但對領導和決策層而言,，可以更好地發(fā)揮參謀作用，提供宏觀決策和政策調整的依據,。
此外,，兩種方式必要時可以互相轉換，項目審計發(fā)現(xiàn)的突出的,、苗頭性,、普遍性的問題,，可以通過審計調查擴大信息量，分析深層次原因,，為決策提供依據,；審計調查中發(fā)現(xiàn)被調查單位有重大的違反國家財經法規(guī)行為，審計機關認為有必要進行審計處理,、處罰的,，可以立項審計，作出審計處理,、處罰決定或移送有關部門,。
由于專項審計調查目的性強，程序相對簡單,，建議和結論層次高,，所以專項審計調查對全面提高審計質量、擴大審計影響往往可以起到事半功倍的效果,。